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第134章 黎明前的测序

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甚至因为我们要提取的是病毒的基因组RNA,丰度更高,操作上反而更容易。」

    「重点是,防止环境里的RNA酶降解样本。」

    江河严肃道:「你们是我亲自教出来的,我对你们的实验规范有绝对的信心,今晚的操作,每一步都必须严格按照我教的规范来,不许有任何多余的动作,听明白了吗?」

    「明白!」陆晓林年纪最长,第一个出声回应。

    「明白了老江,你说咋干就咋干。」陈浩拍了拍脸,让自己彻底清醒。

    「去更衣室,穿两层隔离衣,戴双层乳胶手套,N95口罩,护目镜,进核心区。」

    淩晨3:15。

    柯正提着一个密封的生物安全转运箱来到了实验室门口。

    他把箱子交给江河:「江河,这是马克的深部支气管肺泡灌洗液,已经加了裂解液灭活了。」

    「好。」

    江河接过箱子,转身刷卡进入实验室核心区,立刻说道:

    「第一组,陈浩、向晚,你们负责配制试剂,所有的DEPC水、无水乙醇、异丙醇,全部重新开封新的,确保绝对无RNA酶污染,操作台用RNaseZap喷洒擦拭两遍。」

    「第二组,程溪瑶、唐培,你们负责给所有的移液枪换上带滤芯的枪头,准备好离心管和冰盒。」

    「师兄,亦舟,你们俩配合我,准备过柱子提取。」

    江河站在超净工作台前,将转运箱打开,取出装有灭活样本的冻存管。

    「开始。」

    实验室内。

    严肃,高效。

    这群年纪轻轻的学生,此刻展现出了惊人的纪律性。

    这就是培训的成果!

    江河拿起一把P1000的移液枪,套上带滤芯的枪头。

    「加入Trizol试剂,1毫升。」

    将样本移入新的离心管中,注入Trizol。

    透明的液体瞬间混合。

    「室温静置5分钟,让核蛋白复合体彻底解离。」

    江河看了一眼墙上的挂锺。

    五分钟一到。

    「加氯仿,0.2毫升。」

    「盖紧管盖,剧烈振荡15秒。」

    「静置3分钟。」

    顾亦舟在一旁已经打开了高速冷冻离心机的盖子,温度已经预冷到了4℃。

    「放入离心机,配平,12000转,15分钟。」

    这15分钟极其漫长。

    「滴——」

    离心机停止。

    江河小心翼翼取出离心管。

    在冷光的照射下,管内的液体清晰地分成了三层:

    底层是红色的酚氯仿相,中间是一层薄薄的白色蛋白交界面,最上层是无色的水相。

    所有的病毒RNA,都溶解在这最上层的无色水相中。

    江河深吸了一口气,换了一把P200的移液枪。

    这一步是整个提取过程中最关键的一步。

    如果吸到了中间的蛋白层或者底层的有机相,整个样本就废了。

    他将手肘支撑在台面上,按下移液枪的按钮。

    枪尖精准悬停在无色水相的中央,缓缓吸取了400微升的液体,移入一个全新的无酶离心管中。

    全程,江河的手没有一丝颤抖。

    外科医生的定力,在这一刻展现得淋漓尽致。

    陆晓林在旁边看得头皮发麻。

    ——哪怕是浸淫实验室多年的老研究员,悬空吸取水相时也难免会有细微的晃动,但江河的手就像是被焊死了一样,稳得可怕。

    「加入等体积的异丙醇,陈浩,递冰盒。」

    「加入等体积的异丙醇,陈浩,递冰盒。」

    样本在冰上静置了10分钟後,再次放入冷冻离心机。

    12000转,10分钟。

    再次取出时,管底出现了一点点半透明胶状沉淀。

    「RNA沉淀出来了。」程溪瑶隔着护目镜,眼睛亮了起来。

    江河:「弃上清,加1毫升75%的冰乙醇洗涤沉淀。」

    轻轻悬浮沉淀後,第三次离心。

    7500转,5分钟。

    最後,用移液枪极其小心地吸走所有的乙醇液体,将离心管敞口放置在超净台的通风处。

    「风乾5分钟,不能干透,否则很难溶解。」

    五分钟後,江河加入20微升RNase-free的水,轻轻吹打。

    「去测浓度。」江河把样本递给陆晓林。

    陆晓林拿着样本走到NanoDrop分光光度计前,取了一微升滴在检测基座上,放下悬臂。

    电脑屏幕上立刻跳出一条曲线。

    「浓度120 ng\/μl,A260\/280比值2.02。」陆晓林声音迅速,「师弟,提取极其完美!纯度极高,没有蛋白和苯酚污染!」

    陈浩几个人长长地松了一口气,互相对视了一眼。

    做到了!

    江河毫不犹豫,道:「立刻进行逆转录,RNA极易降解,必须马上把它变成稳定的A。」

    「引物用什麽?」陆晓林问。

    「用随机六聚体引物(Random Hexamers)做全转录本的逆转录。」

    江河走到冰箱前,拿出逆转录试剂盒:「不需要特异性引物,我们在PCR阶段再用甲流通用的HA(血凝素)和NA(神经氨酸酶)保守区引物去钓出目标片段。」

    看着手里的试剂,江河眼神微动。

    其实,如果这真的是一种完全未知的全新病毒,今晚的这几个小时根本连门槛都摸不到。

    光是引物设计就能卡死全中国最顶尖的实验室两周时间。

    但他不一样。

    他记得H1N1的基因图谱,也知道它的外膜蛋白弱点,包括它最容易被哪种引物扩增。

    基本就等同於,拿着标准答案,反向推导解题步骤。

    所以效率才能这麽高。

    逆转录反应体系配制完毕。

    放入PCR仪。

    42℃孵育60分钟,70℃加热5分钟灭活逆转录酶。

    淩晨5:30。

    逆转录完成。

    极其脆弱的RNA终於变成了相对稳定的DNA。

    「准备PCR扩增反应。」

    「我们要分别扩增它的HA基因、NA基因、M基因以

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