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马龙潭晚年担任四平街“红十字会”名誉会长、道德会会长和直鲁同乡会会长。1940年2月，病逝于四平寓所，享年84岁（虚岁）。1948年迁葬郊区房身沟屯。
马龙潭虽然身为旧中国的军阀、官僚地主，但他出身清贫，关心人民疾苦，兴办了许多公益事业。
他写得一手好字，尤擅行草，书法刚柔相济，潇洒流畅。
1900年7月沙皇俄国借口保护中东铁路及南满洲支线出兵东北，8月上旬俄国军队一部从旅顺口北犯，马龙潭率部前往阻击，连败俄军。
俄国军队占领奉天后，马龙潭奉命保护兴京（辽宁省新宾满族自治县）清朝皇帝祖陵有功，清德宗爱新觉罗·载湉特赏赐四品花翎顶戴。
1903年，被清朝招抚的忠义军首领张桂林随俄军驻通化，得到俄军军官袒护，放纵部下四处掳掠，激起民怨沸腾。
马龙潭决定除掉这一祸害，于是设计捕杀了张桂林。张桂林余部盘踞通化境内蜊蛄河负隅顽抗，图谋报复。
马龙潭冒险率先攀登悬崖，直插驻地，仿佛神兵天降一般，众贼个个心惊胆战，乖乖就擒，张桂林余部至此得到彻底清除。
然而由于清政府的腐败无能，这样一个大快人心的事情却被俄军当做借口，迫于压力，朝廷把马龙潭革职。
不久，清朝又重新起用马龙潭为奉天中路第2营马队统带（相当团长）。
1907年，按年龄为序，马龙潭、吴俊升、孙烈臣、张景惠、冯德麟、汤玉麟、张作霖、张作相8人结拜为盟兄弟。
1909年春马龙潭升任奉天右路巡防军帮统（相当于副旅长），驻军凤城。
1909年10月任统领（相当于旅长）。
1910年秋带兵镇压庄河农民抗捐斗争，清朝皇帝爱新觉罗·溥仪赐“骏声远绍”匾额及银瓶。
1911年夏，启凤书院（凤城一中）学生刘德峰和同盟会由奉天派来的2名青年鼓动推翻清朝统治，实现共和，遭到逮捕。
在押往巡防骑兵营（凤城市第六粮店后院）途中，大骂马龙潭是清朝看家狗，当即被马龙潭砍死于小石桥边（凤城市东方红仪表厂后面）。
张作霖一直对马龙潭的才能心存疑忌，认为马龙潭论文论武都远高于己，所以处处防备、打压马龙潭。
1920年，张作霖解除了马龙潭陆军中将东边镇守使军职，将他调任洮昌道尹辽源交涉员并总办辽源商阜事宜。
马龙潭在洮昌任上减赋税、办学校，兴利除弊，深得百姓拥戴。
在张作霖发动的与吴佩孚之间的直奉大战爆发前，马龙潭亲自到奉天找张作霖，陈说利害，希望直奉两系尽释前嫌，联合南方各派力量，共定华夏大局，共同对付日本人越来越昭然若揭的侵华野心。
可是利欲熏心的张作霖不但不听从劝告，反而更加重了对马龙潭的疑忌，怕马龙潭有深厚的群众基础，一旦他公开反对内战，将会破坏他的称霸计划。
所以1922年3月再次将马龙潭调任四洮铁路督办兼东三省巡阅使署高等顾问与黑龙江省军政两署顾问。
马龙潭上任不久，就听说北京交通部欲派一个叫郭则泌的来充任四洮铁路工程局长，马龙潭早就听说此人是亲日派分子，甘当汉奸，当即大怒，拒不接受，北京当局只好收回成命，另委他人。
四洮铁路开工之初，一些人受日本人收买，意欲将筑路权承包给日本大仓株式会社，马龙潭毫不客气地给顶了回去。
他怒不可遏地质问道：“郑洮铁路与京绥铁路孰难孰易？”
并明确表态：多年前詹天佑先生能做到的，我们今天更应该做到，把国家的筑路权拱手让给外国人，说轻了是我辈无能，说重了就是卖国，在马龙潭的坚持下，郑洮铁路全部由国人自己设计完成，大长了国人的志气。
1931年“九一八”事变后，日本占领东三省，并建立伪满州国，马龙潭自知无力回天，乃辞去一切职务，隐居四平，宁可过清淡贫穷的生活，也不为日本人的高官厚禄所诱惑。