桌上和德意志诸国谈判，作为战争的失败方，丹麦政府宣布放弃抵抗，普奥两国也停止脚步，双方所有敌对行动停止，战争结束。
1864年8月10日，丹麦国王克里斯蒂安九世签订了初步的和平条约，放弃了他在两公国的权利，转而支持奥地利帝国和普鲁士国王。
10月30日的维也纳条约，丹麦将这些地方全部割让给奥地利和普鲁士。
第二次石勒苏益格战争。
丹麦国土倒退250公里，丧失百分之四十的国土，和近四成的人口，总人口从260万减少到160万，其中包括石勒苏益格地区的20万丹麦人，丹麦在日德兰半岛上的实力大减。
普鲁士通过这次战争夺得了石勒苏益格公国的主导权，军队开始进驻石勒苏益格地区，取得重要的港口城市基尔，基尔运河是德意志地区绕开丹麦海峡的重要通道，大大提升了普鲁士的出海能力。
奥地利帝国也在这次战争中获得了荷尔斯泰因公国，战争以普奥的胜利为结果，第二次石勒苏益格战争落下帷幕。